Ha sede nella parte monumentale di un antico convento domenicano sito in piazza San Marco a Firenze. La fama del museo, la cui architettura è un capolavoro rinascimentale progettato da Michelozzo, si deve soprattutto alla presenza di opere di Beato Angelico (l’Annuciazione), presenti in tanti ambienti del convento. Un’ala è dedicata ai pittori della cosiddetta scuola di San Marco, Fra’ Bartolomeo, Mariotto Albertinelli e i loro allievi che pure vissero e lavorarono qui; mentre un’altra parte del museo ospita il lapidario e i resti di edifici demoliti nel periodo del “risanamento”, quando Firenze divenne capitale del nuovo Regno d’Italia.